Такого музея, как мне думается нет. Однако и думать, что все распихано по запасникам нельзя. Во первых можно посмотреть экспозиции ГИМа (гос. исторический музей в Москве). Там есть хорошие экспозиции по разным дохристианским культурам России. Правда нигде прямо не говорится, что те культуры были языческие. Видимо считается что это ясно и так каждому. Просто к примеру приводятся археологические находки по дъяковцам (ранний железный век) или по славянским племенам. Но в ГИМе голову быстро "забивает" непонятная терминология названий культур и концентрированная масса материала, невозможно во все вникнуть.
В Питере стоит посмотреть как как Эрмитаж ( к примеру есть замечательная выставка скифских находок с Алтая, мумии, деревяные срубы, ковры, и прочее от кочевников). В Русском музее есть экспозиции о древнеславянских находках из курганов, это тоже язычество.
Однако в прошлом году меня изумил Этнографический музей Питера, шел смотреть русское язычество, а оказалось, что залы постоянной
экспозиции посвящены еврейским общинам России?
Ну разве нельзя было сделать это где-то в выставочном зале сбоку? Кстати там же на первом этаже представлены костюмы народов бывшего СССР, есть и "русские" одежды, а так же бытовая утварь.
Знаю, что и в региональных музеях есть о язычестве, правда как правило довольно мало, но к примеру в Рязани в картинной галерее прекрасная экспозиция женского костюма, там просто одно язычество на рубахах, хотя рубахи 18-19 века изготовления. Но это один зал, но он стоит того, чтобы посмотреть.
В Муромском музее тоже первый этаж - о язычестве. Но он не "раскручен", так как плохо представлен переход от археологических находок к "языческому действию".
А там есть и мурома и поздняковцы (эпоха бронзы), и фатьяновцы (протославяне).
Сам музей "крутит" сейчас христианство, потому как кругом одни монастыри и все музейщики - христианки прихожанки.
В Москве сейчас проектируется экспозиция в Коломенском о дъяковцах, может года через два появится, это предки мери которая летописная и ходила сажать Ярослава Мудрого на Киевский престол. О языческой Москве вышла прекрасная книга "Культура средневековой Москвы"М., Наука, 2004. Ее можно использовать как путеводительпо языческим местам, это уже будет археологический туризм.